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循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)檢測(cè)研究進(jìn)展概要

   日期:2018-04-20     瀏覽:137    
核心提示:發(fā)布日期:2018-04-20   近日,美國(guó)臨床腫瘤學(xué)會(huì)(ASCO)和美國(guó)病理學(xué)家協(xié)會(huì)(CAP

發(fā)布日期:2018-04-20

 

  近日,美國(guó)臨床腫瘤學(xué)會(huì)(ASCO)和美國(guó)病理學(xué)家協(xié)會(huì)(CAP)組織了專家委員會(huì)聯(lián)合對(duì)已經(jīng)發(fā)表的臨床ctDNA檢測(cè)的論文進(jìn)行了綜述分析,該文較為全面的總結(jié)了ctDNA(循環(huán)腫瘤DNA)檢測(cè)當(dāng)前的研究狀況以及需要進(jìn)一步解決的問(wèn)題,也為未來(lái)的研究提供了框架性建議,更好地指引和規(guī)范了ctDNA檢測(cè)技術(shù)的發(fā)展和應(yīng)用。

  一、背景介紹

  液體活檢技術(shù)是指對(duì)血液等體液標(biāo)本進(jìn)行診斷分析,其具有取樣便捷、微創(chuàng)、便于實(shí)現(xiàn)動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)、能更完整的反應(yīng)腫瘤基因信息,克服單一病灶取樣的空間限制等優(yōu)勢(shì)。其中,檢測(cè)血液ctDNA是目前液體活檢領(lǐng)域發(fā)展最快的檢測(cè)方法。

  通過(guò)文獻(xiàn)檢索搜索了1338份ctDNA檢測(cè)相關(guān)的臨床文獻(xiàn),最終篩選出77篇文章匯總分析。并主要針對(duì)實(shí)體瘤中ctDNA突變以及DNA序列或拷貝數(shù)變異情況,分別從樣本前處理、分析有效性、結(jié)果解讀和報(bào)告、臨床有效性和實(shí)用性幾個(gè)方面進(jìn)行了分析總結(jié),主要內(nèi)容如下:

  二、樣本前處理

  在ctDNA檢測(cè)樣本前處理步驟中存在眾多不確定因素,而這些變量可能會(huì)影響樣本質(zhì)量、DNA的提取等,從而影響后續(xù)的檢測(cè)評(píng)價(jià)。

  目前研究表明最佳的樣本類型是血漿,且最好采用含細(xì)胞穩(wěn)定劑的抗凝管或EDTA抗凝管采集血液。采用EDTA抗凝管時(shí),應(yīng)在采樣后6小時(shí)內(nèi)盡快處理,分離血漿。該過(guò)程中應(yīng)盡可能降低白細(xì)胞溶解產(chǎn)生的大量細(xì)胞游離DNA對(duì)ctDNA的稀釋影響。

  整體而言,在樣本抽血、采集、處理、儲(chǔ)存、運(yùn)輸、DNA提取純化等步驟中存在諸多可能影響后續(xù)檢測(cè)的因素。此外,患者相關(guān)的生物學(xué)因素也可能會(huì)影響患者血液中游離DNA的釋放,如吸煙、貧血、炎癥類非惡性疾病、自身免疫性疾病等。而目前這方面的研究還很有限,諸多問(wèn)題尚待解決。

  三、分析有效性

  分析有效性指能準(zhǔn)確、可靠地檢出突變的能力,包括準(zhǔn)確性、靈敏度、特異性、重復(fù)性等。目前,評(píng)價(jià)血漿ctDNA檢測(cè)準(zhǔn)確性和特異性的方法主要是通過(guò)與配對(duì)組織樣本檢測(cè)進(jìn)行方法學(xué)比對(duì)。研究表明,血漿ctDNA檢測(cè)與組織檢測(cè)存在不一致情況,該情況除了受到分析性能(如分析靈敏度)的影響,也可能是其他生物學(xué)因素引起的,如癌癥類別、腫瘤分期、腫瘤空間和時(shí)間的異質(zhì)性、組織血漿取樣時(shí)間差等。

  由于血漿中ctDNA含量較低,對(duì)于檢測(cè)下限的研究很重要,考慮到上述生物學(xué)因素可能的影響,建議納入細(xì)胞系或人工構(gòu)建的標(biāo)準(zhǔn)化的樣本,對(duì)檢測(cè)限附近的檢出能力進(jìn)行研究驗(yàn)證。目前,不同突變類型的最佳檢測(cè)下限還未進(jìn)行系統(tǒng)性研究,該檢測(cè)限也可能將根據(jù)預(yù)期用途而變化。

  此外,當(dāng)前不同的ctDNA檢測(cè)能力存在差別,未來(lái)的研究應(yīng)考慮進(jìn)行更多大型的跨平臺(tái)比對(duì)研究。同時(shí),下一步應(yīng)綜合考慮樣本前處理和分析檢測(cè)中的變量開展研究,確保檢測(cè)質(zhì)量。最后,建議應(yīng)根據(jù)預(yù)期用途研究建立ctDNA檢測(cè)最低的分析靈敏度和特異性,以促進(jìn)其臨床應(yīng)用。

  四、結(jié)果解讀和報(bào)告

  ctDNA檢測(cè)結(jié)果的解讀面臨著一些特有的挑戰(zhàn),尤其應(yīng)注意以下幾點(diǎn):

 ?。?)當(dāng)ctDNA檢測(cè)報(bào)告顯示對(duì)某一特定基因突變可以采取治療措施時(shí),建議將該檢測(cè)結(jié)果與其他臨床信息、腫瘤分析的信息進(jìn)行整合,闡述與治療方案間的整體相關(guān)性。在可檢測(cè)胚系突變的應(yīng)用中,注意對(duì)于模棱兩可的結(jié)果,或可能是胚系突變的結(jié)果進(jìn)行后續(xù)的檢測(cè)和解讀。

 ?。?)對(duì)意義不明的克隆性造血情形中的基因突變應(yīng)謹(jǐn)慎解讀。

 ?。?)不同患者中ctDNA占總細(xì)胞游離DNA的比例差異較大,不同樣本前處理過(guò)程得到的樣本中白細(xì)胞釋放的游離DNA也不盡相同,需要進(jìn)一步研究ctDNA檢測(cè)的基因突變豐度的預(yù)后意義。

 ?。?)ctDNA檢測(cè)結(jié)果可能與組織檢測(cè)結(jié)果不一致,考慮到釋放在血漿中的ctDNA含量通常較低,尤其是在中樞神經(jīng)系統(tǒng)癌癥中血腦屏障的影響可能較大,因此對(duì)于未檢出結(jié)果要進(jìn)行謹(jǐn)慎解讀和說(shuō)明。

  五、臨床有效性和實(shí)用性

  文章根據(jù)ctDNA檢測(cè)不同的預(yù)期用途,從以下幾個(gè)方面展開,主要關(guān)注了在轉(zhuǎn)移性癌癥中的應(yīng)用。

  (一)應(yīng)用于晚期癌癥中的治療方案選擇

  ctDNA檢測(cè)在該方面應(yīng)用的研究相對(duì)較多,目前也有獲批的基于PCR技術(shù)檢測(cè)非小細(xì)胞肺癌患者中的EGFR突變狀況的產(chǎn)品。其臨床實(shí)用性主要是通過(guò)對(duì)之前的臨床試驗(yàn)中獲得的樣本進(jìn)行回顧性檢測(cè)分析得到的。其中,需要特別注意的是,由于存在部分假陰性結(jié)果,尤其是在T790檢測(cè)情形中,對(duì)未檢出的結(jié)果應(yīng)盡可能通過(guò)后續(xù)的組織檢測(cè)進(jìn)行確認(rèn)。

  此外,由于晚期癌癥中存在腫瘤異質(zhì)性,ctDNA可能是來(lái)自所有的轉(zhuǎn)移部位,而組織檢測(cè)通常是在單一轉(zhuǎn)移部位或原發(fā)病灶處進(jìn)行的。高靈敏度的ctDNA檢測(cè)可能檢測(cè)到亞克隆突變,在不同情形中,亞克隆突變可能的影響還值得進(jìn)一步研究。

  整體而言,除了已獲得監(jiān)管部門批準(zhǔn)的檢測(cè)外,大多數(shù)檢測(cè)方法還沒(méi)有充分證據(jù)表明其臨床有效性,并且大都不具有臨床實(shí)用性證據(jù),接下來(lái)的研究應(yīng)盡可能納入與預(yù)期人群接近的患者,同時(shí)樣本要經(jīng)過(guò)嚴(yán)格的質(zhì)控,開展前瞻性的臨床研究充分驗(yàn)證其臨床意義。

 ?。ǘ?yīng)用于療效監(jiān)測(cè)

  ctDNA檢測(cè)應(yīng)用于療效監(jiān)測(cè)時(shí),主要是定量檢測(cè)ctDNA隨時(shí)間變化的情況。然而在該過(guò)程還存在諸多挑戰(zhàn),包括考慮樣本前處理和分析過(guò)程的有效性和可重復(fù)性的影響,需要研究驗(yàn)證不同實(shí)驗(yàn)室結(jié)果間的可互換性問(wèn)題,建立量化DNA負(fù)荷的最佳單位等。

  盡管在少量的研究中建立了ctDNA水平與治療反饋間的關(guān)系,但目前該應(yīng)用的臨床有效性證據(jù)尚不足,也缺乏有力的臨床實(shí)用性證據(jù),需要進(jìn)行進(jìn)一步嚴(yán)格設(shè)計(jì)的臨床研究。

  (三)應(yīng)用于殘留病灶的檢測(cè)

  盡管理論上在患者接受手術(shù)等根治性治療后,可根據(jù)ctDNA的變化情況來(lái)檢測(cè)殘留腫瘤組織,以在早期階段診斷或輔助判斷癌癥復(fù)發(fā)情況。然而目前尚無(wú)證據(jù)表明ctDNA可達(dá)到類似于白血病管理中的微小殘留病灶檢測(cè)能力,而且該方面的研究大都是回顧性的,其檢測(cè)的假陰性率和假陽(yáng)性率還未確定,臨床有效性證據(jù)有限,臨床實(shí)用性也尚不明確,建議未來(lái)進(jìn)行前瞻性隨機(jī)研究。

 ?。ㄋ模?yīng)用于無(wú)癥狀人群的腫瘤篩查

  考慮到可以在早期癌癥患者中檢測(cè)到ctDNA,但其含量通常較低,該檢測(cè)在無(wú)癥狀人群的癌癥篩查方面的應(yīng)用備受關(guān)注。但目前對(duì)于實(shí)體瘤領(lǐng)域,還缺乏相關(guān)有效的臨床有效性和臨床實(shí)用性證據(jù),對(duì)于檢測(cè)假陽(yáng)性(包括檢測(cè)技術(shù)上和生物學(xué)因素)的程度也尚不明確。

  六、結(jié)論

  盡管ctDNA檢測(cè)在腫瘤診療領(lǐng)域顯示出諸多優(yōu)勢(shì),但目前該技術(shù)在樣本前處理、分析性能、臨床有效性和臨床實(shí)用性方面還有諸多待研究的問(wèn)題,尤其在臨床有效性和臨床實(shí)用性證據(jù)方面,除了個(gè)別已批準(zhǔn)的產(chǎn)品在一定程度上表明了其臨床用途外,大多數(shù)用于癌癥篩查、治療方案選擇、療效監(jiān)測(cè)、殘留病灶檢測(cè)領(lǐng)域的檢測(cè)都缺乏有力的臨床證據(jù),現(xiàn)階段不宜在臨床廣泛開展,接下來(lái)的研究中應(yīng)盡可能納入所有可能的預(yù)期人群類型,通過(guò)嚴(yán)格設(shè)計(jì)的臨床研究來(lái)充分驗(yàn)證其臨床意義。

  參考文獻(xiàn):

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[4] 劉毅,張少華,吳一龍,等。 中國(guó)臨床腫瘤學(xué)進(jìn)展[M]. 人民衛(wèi)生出版社,2017:435-437.

 

來(lái)源:中國(guó)器審

 
 
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